Shotwell vám umožňuje označit si důležité fotografie. U fotografie, která je označená, se pravém horním rohu objeví malá vlaječka. V postranním panelu pak můžete vybrat položku Označeno, aby se vám zobrazily všechny označeném fotografie.

Vlaječkou si označte fotografie, které jsou něčím význačné. Záleží čistě na vás, k jakému účelu si to vyložíte. Například si můžete označit všechny fotografie, které budou potřebovat ručně doladit nebo všechny fotografie, které budete chtít poslat přátelům.

U označování je užitečné, že s označenými fotografiemi můžete pracovat se všemi naráz jako sadou. Například můžete vybrat zobrazení Označeno a následně všechny označené fotografie odeslat na sdílecí server.